Průkaz SARS-CoV-2 metodou RT-PCR
Parametry metody
Metoda přímého průkazu. RT-PCR. Extrakce RNA z odebraného materiálu (tj. z virologického transportního média) a z provedení RT-PCR pomocí postupů validovaných pro detekci virových nukleových kyselin z klinických vzorků. Mezinárodní postupy, publikované pod hlavičkou WHO, se shodují na potřebě stanovení minimálně dvou oblastí virového genomu pro účely detekce SARS-CoV-2. Standardně doporučované cíle pro detekci zahrnují otevřené čtecí rámce ORF1ab (tedy geny pro RNA-dependentní RNA polymerázu RdRP), nukleokapsidový protein N, obalový protein E a povrchový glykoprotein S, a to vždy v kombinaci s interní kontrolou detekce.
V laboratoři je také dostupná metoda přímého průkazu RNA viru z odebraného materiálu bez potřeby izolace RNA.
Transport co nejdříve do laboratoře při 2-8°C. Lze uchovávat při 2-8 °C max. 72 h od odběru, delší skladování možné při -70°C.
Při podezření na COVID-19. Indikace preventivní nebo diagnostická.
Možnosti výsledku: pozitivní, negativní, nelze hodnotit (inhibice PCR) nebo hraniční výsledek. Hraniční a nejasné výsledky lze poslat ke konfirmaci do NRL pro SARS-CoV-2.
